آزمایشگاه مرکزی پاتوبیولوژی در سال ۱۳۴۷ با هدف ارائه خدمات آزمایشگاهی بالینی و آسیب‌شناسی در پایتخت تأسیس شد. این مجموعه از آغاز فعالیت با تلاش پزشکان و کارکنانی پایبند به کیفیت، همواره در مسیر بهبود مداوم گام برداشته و برای اجرایی ساختن این هدف سه مرحله تغییرات گسترده در فضا، تجهیزات، آزمایشات تازه و افزایش تعداد کارکنان را دنبال کرده است. هم اکنون تعداد پرسنل این مرکز به ۲۲۰ نفر می‌رسد. پانزده پزشک متخصص آزمایشگاه بالینی و آسیب‌شناسی مسوؤلیت سرپرستی کل بخش‌های فنی، پذیرش، نمونه‌برداری و پاسخ‌گویی را بر عهده دارند. بخش‌های فنی شامل پاتولوژی، سیتولوژی، ایمونو هیستوشیمی، بیوشیمی، هماتولوژی، هورمون‌شناسی، ایمونوسرولوژی، الکتروفورز، میکروب‌شناسی، بیولوژی مولکولی، پارازیتولوژی، آزمایشات تجزیه ادرار، سیستم انعقاد خون، بخش تضمین کیفیت، فناوری اطلاعات و مهندسی الکترونیک می‌شود. این آزمایشگاه جهت ارتقای سطح کیفی، سیستم مدیریت کیفیت را بر پایه استاندارد بین‌المللی ISO 9001:۲۰۰۸ پیاده‌سازی کرد و در خرداد ماه ۱۳۸۹ موفق به دریافت گواهینامه از سازمان BSI انگلستان شد. لازم به ذکر است که در سال ۱۳۹۰ ممیزی مراقبتی انجام شد و گواهینامه تمدید گردید و پس از آن در تاریخ ۱۸ آبان ۱۳۹۰ گواهی اهتمام به کیفیت از سازمان ملی استاندارد ایران نیز کسب شد.